Magyarország természetes környezete – termékeny síkságainak, előnyös klímájának és bőséges vízellátottságának köszönhetően – kedvező mezőgazdasági feltételeket biztosít. A finomító az ország kukoricatermő területének a szívében helyezkedik el és jelentős értéktöbbletet ad a régióban termelt gabonához. Emellett Magyarországot nemzetközi szinten is jelentős zöldenergia előállítóként és takarmány alapanyag exportőrként tette ismertté.
A Pannonia Bio pozitívan hat az Európai Unióra a klímavédelmi intézkedések, a közlekedési szektor szén-dioxid mentesítése, a fenntartható mezőgazdasági gyakorlatok alkalmazása, a fosszilisenergia-forrásoktól való függetlenség és az importált takarmánytól való függőség mérséklésének köszönhetően. A vállalat tiszta, zöld etanolgyártó tevékenységét a Magyar Kormány üdvözölte, mint értékes hozzájárulást az ország tiszta és független jövőbeli energia-portfóliójához.
A Pannonia Bio közvetlenül és közvetetten is hatást fejt ki a magyar gazdaságra. Ezeket egy 2020-as tanulmány regionális és ágazati szinten is pozitívnak találta. A közvetlen hatások a foglalkoztatás, az export, az adóbevétel, a hozzáadott érték, illetve a bevétel növekedését eredményezik az ellátási láncban. A közvetett hatások pedig a szállítók bevételének gyarapodása, a kiadások multiplikátor hatása és a többletkereslet létrehozása a gazdaságban.
A Pannonia Bio a következő 10 évben összességében várhatóan több mint 1 milliárd euróval járul hozzá a magyar GDP-hez. A becslések szerint a vállalat több mint 5 ezer új munkahelyet hoz létre, és több mint 200 millió euróval növeli a költségvetés adóbevételeit. A Pannonia Bio éves közvetett hatása a kereslettől függően 20-100 millió euró. A magyar agrárszektorra különösen az innováció serkentésével, a hatékonysággal, a hozamnövekedéssel, valamint a mezőgazdasági berendezések és technológia iránti növekvő kereslet révén van hatással.
A Pannonia Bio termékeit Európa legtöbb országába, illetve az öreg kontinensen kívülre is exportálják, ami a vállalatot egy globális méretű és ambíciójú helyi vállalkozássá teszi. Magyarország kereskedelmi exportjához 2010 és 2015 között 434 millió euróval járult hozzá.
