A Pannonia Bio üzemében hatalmas gabonaraktárak is helyet kaptak. Az ömlesztett, valamint a teherautó-alapú áruátvevő rendszerek lehetővé teszik a gabonabeszállítók számára, hogy egyenesen az üzemünkbe transzportálják a terményüket. Innen a szárított kukoricaszemeket az őrlő silóba továbbítjuk.
A kukoricaszemeket darává, illetve lisztté őröljük. A kukoricaszemek kemény külső héját több kalapácsos örlő segítségével törjük meg, így növelve a keményítő felületét. A kukoricaőrleményt a padozatról tápláljuk a gyártási sorokba az etanolkészítési vagy egy szabadalmaztatott rostanyag-kivonó eljáráshoz. Rost kivonása: a kukorica megőrlését követően a rostokat elválasztjuk egy külön anyagáramba. A rost kivonása után abból különböző anyagok állíthatók elő, egyebek mellett arabinoxilánprebiotikumok, cellulóz, illetve xylit.
A kukoricarost extrahálását követően a fennmaradó darálékot felhevített vízzel és enzimmel elkeverjük, hogy így cefrét kapjunk. A cefre ezután egy főzési és elfolyósítási eljáráson megy keresztül. A lejátszódó keményítőhidrolízis során a cukrok glükózzá (egy egyszerűbb szénhidráttá) bomlanak le.
A cseppfolyósító gyártósorok a fermentálók feltöltésére szolgáló gyártósorokhoz továbbítják a cefrét. Az erjedés megindításához itt kerülnek hozzá az élesztőgombák. A folyamat során a kukoricacefrében jelenlévő cukrok etanollá alakulnak át. Az élesztőgombák és a tartályban lévő alkohol mennyisége közötti kényes egyensúlyt fenn kell tartani, mivel a magas alkoholkoncentráció elpusztíthatja az élesztőgombákat. Ez utóbbiak átalakítása, táplálása céljából nitrogént adagolunk a sörléhez. A fermentált cefrét ezután áthelyezzük a fermentálóból egy tároló tartályba – ettől kezdve a cefrét már nem cefrének, hanem sörlének nevezzük.
A desztilláció során hő és speciálisan tervezett lepárló tornyok segítségével elválasztjuk a vizet az alkoholtól. A dehidratálási módszereket arra használjuk, hogy a vizet teljes mértékben eltávolítsuk az etanolból.
A híg szeszmoslékból (amelyből eltávolítottuk az alkoholt) a szétválasztási eljárás során előbb a takarmányipari kukoricaolajat (DCO) vonjuk ki, majd azt egy cukorszirupot tartalmazó tartályba helyezzük, és összekeverjük a sörléből származó egyéb szilárd anyagokkal, hogy így egy fehérjedús állati takarmányt kapjunk: ez a szárított kukoricatörköly (DDGS). Egy kilogramm etanol gyártásával körülbelül egy kilogramm állati takarmány is képződik. A gyártási folyamat során különböző összetevőket alkalmazva kitozánt, aminosavakat és mikoproteint (vagyis gombák által termelt fehérjét) kaphatunk.
A desztilláló oszlopok alján található úgynevezett szeszmoslék (kifőzött cefre) a gabonából és a hozzáadott élesztőből származó szilárd anyagokat, valamint maradék folyadékot tartalmaz. A szeszmoslékot centrifugák segítségével választjuk szét híg szeszmoslékra (5-10 százalék szilárd anyagot tartalmazó folyadékra) és nedves takarmányipari gabonára.
A Pannonia Bio által előállított etanol főként a közlekedési ágazatban jelenik meg, mint a fosszilis üzemanyagok környezetbarát alternatívája, amely képes mintegy 70 százalékkal kevesebb szén-dioxidot termelni, és ez az arány folyamatosan javul. Ami nem a közlekedési ágazat számára készül, az ipari felhasználásra kerül az oldó- és tisztítószer ágazatokban, illetve az italgyártásban. A Pannonia Bio által termelt etanol jelentős potenciállal bír a biológiai alapú anyagok ágazataiban, a csomagolás, bevonatok és fóliák terén való felhasználásban.
A dehidratálásra zeolit-alapú molekulaszűrők alkalmazásával kerül sor. Különleges körülmények között a zeolit magába szívja az etanolból távozó, fel nem szívódott vizet. A zeolit kristályok mind a vizet, mind az etanolt magukhoz vonzzák, a pórusméret azonban túl kicsi ahhoz, hogy az etanol bejusson.
A Pannonia Bio takarmányipari kukoricaolaja (vagyis DCO, az angol Distillers Corn Oil kifejezés rövidítése) egy különleges összetevő, amelyet a takarmánypiaci szereplők számára kínálunk. A Pannonia DCO az állatállomány számára jótékony lutein, zeaxantin, xantofill, foszfor és telítetlen zsírsavak kiváló forrása.
A Pannonia Bio „szárított kukoricatörköly” (DDGS, az angol Dried Distillers Grain with Solubles kifejezés rövidítése), fehérjedús állatitakarmány-összetevő előállításával is foglalkozik, melyet Pannonia Gold márkanéven forgalmaz. A fehérje létfontosságú szerepet játszik az állatok testsúlygyarapodásában, növekedésében és szaporodásában. Ezt a takarmány-összetevőt több mint 27 európai, közel-keleti, afrikai és ázsiai országban forgalmazzuk.